生物信息分析 生信分析难不难

一帘幽梦2022-06-23 15:45:03888

生物信息学主要处理和分析哪些高通量数据类型,目前常用生物信息学分析方法有哪些,生物信息分析师都需要具备哪些技能,生物信息分析工程师是干什么的?做一单生物信息学分析需要多长时间,生信分析是什么意思?

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生物信息学入门必备基础知识

高通量数据类型主要包括基因芯片和基因测序,我估计你想知道的是具体的内容。

具体的内容其实是指的高通量测序技术的应用,例如microarray,RNA-Seq,Exome-Seq,Target-Seq,Whole-genome-sequencing,宏基因组,16S RNA,microRNA,lncRNA测序等。

研究的问题就更五花八门了,像现在精准医疗的概念很火,主要是以基因测序为入口,后面的应用,例如产前诊断,孕前诊断等,甚至像亲子鉴定,肿瘤靶标等都可以通过生物信息学的分析手段来搞定。

生物信息分析分为几个层次,第一个层次基本上就是用别人做好的成熟软件,直接分析出你要的结果,再深入就是你会根据问题找到更合适的一些软件或者模块,自己组建一些分析流程,包括自己写一些辅助的程序脚本,更深入的层次就是市面上没有符合你要求的软件或者统计算法,你依据自己的需求,定制自己的分析过程,自己从头开始写基础程序,写统计算法,写模型等。到了这个程度就没有那么多限制了,主要比的是个人的思维想法以及眼界开阔程度。

现在也很多生物信息的分析方法应用在大数据的各个领域。本质是各种统计思维方法的实现,找出特定的模式结果。

生物信息学目前待解决的问题

现在比较热门的数据库包括GEO、TCGA

GEO分析主要是芯片做差异分析,得到差异基因,差异基因可以做GO、KEGG功能富集分析

TCGA数据库是癌症分析的利器,可以做差异基因,差异miRNA,差异lncRNA,下载和整理临床数据,做生存分析,高难度的COX分析

这两个数据库可以发到不错的文章

生物工程师的就业前景

1. 计算生物学、统计学、机器学习、生物信息学等相关专业

2. 国内毕业者需硕士学位或以上 (或国内本科及两年以上相关工作经验) / 海归人员需国外的本科学位或以上

3. 熟悉Linux/Unix操作系统,有HPC环境背景优先考虑

4. 熟悉生信流程创建

5. 精通PerI、R (如会Matlab、Python、C/C++中两种以上编程语言可加分)

6. 具备较强的中英文文献查询与阅读能力,并做英文书面报告

7. 精通单细胞、高通量测序数据的分析全流程者优先考虑

生物信息分析师怎么考

生物学研究时,实验下游的数据分析部分需要借助计算机编程、数学统计、现有软件等手段来得到实验结论。

生物信息工程师就是做这部分工作的,主要有分析思路的设计、实现等。

数据大多来源于dna测序仪,以及其他设备。

生命科学数据分析好就业吗

做一单生物信息学分析需要至少半个小时。

生物信息学是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。

其研究重点主要体现在基因组学和蛋白质组学两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。

生物信息学是在大分子方面的概念型的生物学,并且使用了信息学的技术,这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法,并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息。

生物信息学的发展经历了3个阶段:

第一个阶段是前基因组时代。这一阶段主要是以各种算法法则的建立、生物数据库的建立以及DNA和蛋白质序列分析为主要工作。

第二阶段是基因组时代。这一阶段以各种基因组计划测序、网络数据库系统的建立和基因寻找为主要工作。

第三阶段是后基因组时代。这一阶段的主要工作是进行大规模基因组分析、蛋白质组分析以及其他各种基因组学研究。

以上内容参考:百度百科--生物信息学

生信分析难不难

生信分析,意思如下:
生信分析是生物信息分析的意思。生物信息是反映生物运动状态和方式的信息。遗传密码便是生物信息。自然界经过漫长时期的演变,产生了生物,逐渐形成了复杂的生物世界。
生物信息分析师是具备生物学,计算机以及统计学知识,从事基因相关数据分析的专业人员。其工作内容主要是通过综合应用现代分子遗传技术、计算机技术、信息技术等学科知识,并结合分析对象特征,对数据进行序列比对、基因识别、变异检测、蛋白质结构预测、基因表达等分析。

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